热图怎么看差示扫描量热图怎么看

2023-08-11 20:49:27 浏览

这个热图上你会得到两个信息,第一是表达量和颜色关系:

热图怎么看差示扫描量热图怎么看

高原红就是高表达,原谅色就是低表达。当然,由于这个工具是聚类热图,所以左侧和顶上,会有聚类的树状图:

其实这个在GEOAnalysisTool里也能进行聚类,最常用的就是HCL分层聚类,怎么说呢,实际上就是按照表达的具体数值,用皮尔森法或者别的什么方法,比较基因或者样本之间的相似度。把表达模式相似的归为一类,有点像序列比对吧。

主要看两个颜色,一个白色,一个黑色,白色证明你的体内温度过高,这个提示身体里有炎症、增生或肿瘤,黑色表示这个部位温度过低,预示着一些慢性疾病,供血不足或组织坏死的可能性。其它颜色不用过多关注,这也是我在参加TMT医用红外热像仪培训的时候老师告诉我的。

上面这张图是用TMT生命热图做的红外热成像报告,前额有一个明显的H热源,提示这个人睡眠线不好,质量非常差。

当然,最主要的是找一个经验丰富的医生帮你看报告,这样更好一点。这些报告都需要很专业,且有经验的医用红外热像仪评估师才能看明白,它的功能是非常强大的,小的像缺钙,静脉曲张,结石、颈椎,腰椎不好都可以看出来,大的像各种肿瘤也可以通过热源的表现观察出来,所以TMT医用红外热像仪会定期组织评估师的培训,由丰富经验的医生授课,帮助医院的评估师提升在医用红外成像这方面的能力。

么看

我不是很熟悉,简单说两句抛砖引玉一下。

1。左侧的文本应该是基因编号,热图的每一行代表一个基因(或mRNA?)。

2。下方的文本应该是样本编号,热图的每一列代表一个样本。

3。上方的树状结构代表样本之间的相似度聚落关系。比如从左往右,一,二号样本的模式最为相近,三,四之间也互相类似。。。如果打比方,一二是亲兄弟,三四是亲姐妹,这四个全是一个家里面的孩子,五是他们的表姐。而六七八要再隔一辈,是爷爷的兄弟(伯公)的孙子辈。再往右,大家的亲缘关系就比较远了,左边8个样本和右边11个样本分为两组,相互之间有显著差异。

4。右边的树状结构代表基因之间的相似度聚落关系。道理类似以上。结果相似的基因,很有可能在染色体上面位置相近,也有可能是受到相同transcriptionfactor调控而表达的mRNA。

热图报告首先看看温标,知道图像的温度范围,其次是看看发射率值,了解数据是否可信。

然后再看图像内容,最高温度?,关键部件的温度?,温度分布趋势如何?,

绝对温差——比环境温度高出多少度?

相对温差——同类的同位置进行比较,找出异常的部位。

本文版权声明本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容,请联系本站客服,一经查实,本站将立刻删除。