瘦腿针的后遗症主要有以下三个：
一、感染，在注射瘦腿针的过程中，如果操作失当，会将细菌或病毒通过针头带入到肌肉层，这样会时有发生肌肉层的感染，如果感染在局部可以口服抗生素，如果感染经血液播散到浑身，病人会发烧，就须要静脉用到抗生素。
二、小腿无力，瘦腿针的主要成份是肉毒素，肉毒素注射到肌肉上，通过阻断神经对肌肉的营养素效用，而使肌肉渐渐衰退。这时就需注射合适的剂量，如果注射剂量过多，小腿肌肉萎缩会较为严重，这样小腿的力量就会受到一定影响。
三、小腿外形受影响，由于瘦腿针主要是注射到相应肌肉上，如果操作失当，将瘦腿针注射到其它肌肉上。