南京是华东版北京，政治地位与地理位置相较杭州更为显赫。而杭州则俨然是华东的第二个上海，是华东地区的经济区域中心，未来更可能成为互联网金融的桥头堡。
所以，南京相对于杭州来讲，经济是差一些的，但是按照天津的强势复兴，外界普遍认为南京作为同样政治地位优渥的城市也会跟着抬头。南京对于杭州，他的王牌显然不是工业经济，而在于强大而深厚的人文底蕴与科教规模。金陵自古繁华地，佳人才子荟萃更不用多说。个人觉得南京的城市包容性在整个中国最为发达的华东地区是仅次于上海的，在这里不管你来自何方，都能被接纳和成长。而经过青奥会的承办，相信南京的城建又将获得新的面貌，虽然民间普遍不予理解，但以承办完亚运会后的广州来看，这种国际性赛事的承办无形中是巩固和提升城市地位的。
杭州经济发展的很好，但不是长三角最好的。杭州前有上海，甚至苏州制衡，后有宁波和无锡虎视眈眈，可以说压力并不小。杭州以旅游休闲著称，城中环湖而建，依山傍水，风景独好，颇为宜人，所以就宜居层面，杭州无疑胜过南京，并且据说杭州的物价虽高(甚至超广州)但是薪酬水准是优于南京的。而回到经济层面的比较，民间普遍认为杭州的创业氛围与环境亦要优于国资扎堆的南京。
所以好与坏，仅就个人选择标准的不同而有所差异吧。不过刨根问底的刺探这个两座江南一头一尾的城市，可以粗略的总评为一句半斤八两又各有千秋。
南京偏古朴宽容，杭州偏浪漫。各有各的好。
南京，江苏省辖地级市，简称“宁”，古称金陵、建康，是江苏省省会、副省级市、特大城市、南京都市圈核心城市，国务院批复确定的中国东部地区重要的中心城市、全国重要的科研教育基地和综合交通枢纽。
截至2019年，全市下辖11个区，总面积6587.02平方千米，建成区面积823平方千米。截至2020年，南京常住人口9314685人，城镇人口808.53万人，城镇化率86.8%，南京实现地区生产总值14817.95亿元。
历史上南京既受益又罹祸于其得天独厚的地理位置和气度不凡的风水佳境，过去曾多次遭受兵燹之灾，但亦屡屡从瓦砾荒烟中重整繁华。
就业且在中原被异族所占领，汉民族即将遭受灭顶之灾时，通常汉民族都会选择南京休养生息，立志北伐，恢复华夏。大明、民国二次北伐成功；东晋、刘宋、萧梁三番北伐功败垂成。
不论是从经济总量、人口可支配收入、财政和税收占比、企业数量和地理位置来看，还是旅游收入、经济发展模式，特别是对外经济贸易来比，杭州的发展优势更明显，使得杭州的经济实力更胜一筹。
南京自古以来便是“江南首府”的角色，在上海崛起之前，一直是江南地区政治、经济和文化中心，虽然扬州、苏州在经济上曾一度超越南京，但南京作为江南门户的综合地位是稳固的。
直到今天，南京仍然是响当当的025（电话区号）大区中心城市，是华东地区仅次于上海的综合性交通枢纽、大区机构所在地、科技教育文化医疗中心，城市性质和广州、成都、武汉、西安、沈阳有异曲同工之妙。
杭州的历史文化底蕴较之南京，略微逊色，但同样也是做过首都的城市，曾是吴越国和南宋的都城，但比之南京，总有点偏安一隅的感觉。相比南京，杭州的优势在于经济活跃度，特别是民营经济之繁荣、互联网经济之新潮，杭州绝对是全国都数一数二的存在。
这方面，南京和杭州的差距不是一丁点。民营经济的发达，让杭州显得特别有钱，GDP的“含金量”特别高。只要是和钱有关的指标，无论是看城市资金总量、财政收入还是看上市公司数量、500强企业、独角兽数量、富豪榜上榜人数，杭州都是无可争议的中国第五城甚至第四城。