热图怎么看hic热图怎么看

2023-08-15 04:33:30 浏览

主要看两个颜色,一个白色,一个黑色,白色证明你的体内温度过高,这个提示身体里有炎症、增生或肿瘤,黑色表示这个部位温度过低,预示着一些慢性疾病,供血不足或组织坏死的可能性。其它颜色不用过多关注,这也是我在参加TMT医用红外热像仪培训的时候老师告诉我的。

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上面这张图是用TMT生命热图做的红外热成像报告,前额有一个明显的H热源,提示这个人睡眠线不好,质量非常差。

当然,最主要的是找一个经验丰富的医生帮你看报告,这样更好一点。这些报告都需要很专业,且有经验的医用红外热像仪评估师才能看明白,它的功能是非常强大的,小的像缺钙,静脉曲张,结石、颈椎,腰椎不好都可以看出来,大的像各种肿瘤也可以通过热源的表现观察出来,所以TMT医用红外热像仪会定期组织评估师的培训,由丰富经验的医生授课,帮助医院的评估师提升在医用红外成像这方面的能力。

热图报告首先看看温标,知道图像的温度范围,其次是看看发射率值,了解数据是否可信。

然后再看图像内容,最高温度?,关键部件的温度?,温度分布趋势如何?,

绝对温差——比环境温度高出多少度?

相对温差——同类的同位置进行比较,找出异常的部位。

我不是很熟悉,简单说两句抛砖引玉一下。

1。左侧的文本应该是基因编号,热图的每一行代表一个基因(或mRNA?)。

2。下方的文本应该是样本编号,热图的每一列代表一个样本。

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3。上方的树状结构代表样本之间的相似度聚落关系。比如从左往右,一,二号样本的模式最为相近,三,四之间也互相类似。。。如果打比方,一二是亲兄弟,三四是亲姐妹,这四个全是一个家里面的孩子,五是他们的表姐。而六七八要再隔一辈,是爷爷的兄弟(伯公)的孙子辈。再往右,大家的亲缘关系就比较远了,左边8个样本和右边11个样本分为两组,相互之间有显著差异。

4。右边的树状结构代表基因之间的相似度聚落关系。道理类似以上。结果相似的基因,很有可能在染色体上面位置相近,也有可能是受到相同transcriptionfactor调控而表达的mRNA。

一、打开Mapviewer页面,网址为:

在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示:

二、点击“GO”出现如下页面:

三、在步骤二图示的右下角有一个QuickFilter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前面的小方框里打勾,然后点击Filter.出现下图:

说明一下:1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。2、下面参考序列给出了三个,是不同的部门做出来的,经我验证,序列有微小的差异,但总体来说基本相同。尽管你分别点击后,序列代码、序列代码等有所差异,但碱基基本一致,不影响大家研究分析序列。现在普遍采用的是最上面的那个序列,这一条是世界范围的生物科学家用计算机合成的一个序列。我也推荐大家使用这个序列。

四、点击上述三条序列第一条序列(即reference)对应的"Genesseq",出现新的页面,

五、点击上图出现的“Download/ViewSequence/Evidence”,即下载查看序列等功能,

先对上面这张图做点简要的说明,在SequenceFormat(序列输出格式)后面是一个下拉式选择菜单,默认的为FASTA格式,还有一个是GenBank格式。我推荐大家选择GenBnak格式,因为这个格式提供了很多该基因的信息,而FASTA格式只有基因序列。

六、在SequenceFormat后选择GenBank,然后点击下面的Display,目的基因的相关信息和序列就出现在眼前了。点击后如图所示(网页较大,只抓取一小部分以作示范):

在上述打开的网页中,你可以看到基因长度,基因序列,以及这个基因是如何被报道出来的等各种信息。

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