海蛎子肉肥爽滑，味道鲜美，营养丰富，含有丰富的蛋白质、脂肪、钙、磷、铁等营养成份，素有“海底牛奶”之美称。在西方，海蛎子仍被誉为“神赐魔食”，日本人则誉之为“根之源”。在我国有“南方之牡蛎，北方之熊掌”之说。每100克可食部分蛋白质10.9克，脂肪1.5克，钾200毫克，钠462毫克，钙131毫克，镁65毫克，锌9.39毫克，铁7.1毫克，铜11.5毫克，磷115毫克，硒86微克，A27微克，烟酸1.4毫克。含碘量远远高出牛奶和蛋黄。含锌量之高，可为食物之冠，海蛎子中还含有海洋生物特有的多种活性物质及多种氨基酸。
海蛎子的贝壳即是常用中药牡蛎，牡蛎含80%-95%的碳酸钙、磷酸钙及镁、铝、硅和氧化铁等成份，性味咸、涩、凉，有平肝潜阳、滋阴安神、化痰固精止带等功效。临床上常用它与龙骨、板、白芍等配伍，可用于治疗阳亢所致的烦躁不安、心悸失眠、头晕目眩及耳鸣等症；与浙贝、玄参等配伍，能软坚以散结块，适用于瘘疠、痰核等症；若与丹参、泽兰、鳖甲等配伍还可治肝脾肿大；若火煅可用于治疗虚汗、遗精带下、崩漏等症，又因为其有制酸作用，亦可用于胃酸过多，胃溃疡等。如今，牡蛎制剂的临床药用范围正逐渐被人们认识和扩大，可作为抗结核病药，能消除因大量饮酒后引起的恶心和胃部不适。同时对男子有生精强壮作用，还可以降低糖尿病病人的血糖，减少糖尿病的合并症。另外，对更年期综合征、青春期功能性子宫出血、产前产后虚弱，以及动脉硬化、、心绞痛、高血脂、心律不齐、等都有较好的疗效。
肉可生吃，最原汁原味的吃法是直接将海边附着在石头上的海蛎子凿开，挑出肉生吃，但脾虚者忌用。
多服久服，易引起便秘和消化不良。