主要是由于印度的控制。因为在2007年2月，不丹同印度签署经修订的《不印友好条约》。规定不丹对外关系接受印度的“指导”。
所以说外交和军事管辖权属于中央只是广义上说的，但特区仍然有特权，否则就不叫特区了。另外我国和不丹的虽没有建交但关系还是不错的，所以香港回归后其领事馆得到保留。
幅员辽阔的中国包含着14个陆上邻国和6个海洋邻国。随着新中国成立以来至发展至今，我国与世界上大多数国家都建立了外交关系，边界问题已基本得到了解决。然而，就在西南边境与我国西藏接壤的小国家，不丹不仅没有与我国建交，甚至也没有与我国划分明确边界。其中的原因既与本国的文化习俗有关，也与外界限制有关。
不丹国内文化习俗
首先说不丹的文化习俗，不丹虽然是一个世界最不发达国家之一，但却是世界上幸福指数最高的国家之一。因为其恶劣的地理位置导致了其经济发展十分落后以及缓慢。但是随着全球旅游业的迅速发展，不单凭借着。其超高的幸福指数以及独特的自然风光吸引了来自世界各地的国际游客的旅行观光，旅游业也是不丹的主要国家外汇收入。从这一点看，不丹与我国没有建立外要关系其实对齐经济发展并不是很重要。不丹民间的生活态度十分悠闲自在，做也是无视其本国环境所造成，使得他们并不追求在世界上或者地区拥有一席之地，其自身也没有这样的能力，他们更加渴望的是过好自己的生活罢了。
更为重要的一个外界条件限制是因为其南方邻国的大国印度的压力。印度一直对不丹虎视眈眈，但迫于国际压力并没有对不丹采取过军事行动，而是选择不断控制不丹的外交和内政。也就是说，不丹并没有完全自治权。也因此，不丹的外交行动也深受印度的控制。而印度本身就有其野心，并且在我国边境一直保持着傲慢态度，他也同样不希望不丹与中国能够成功的解决边界问题。因此，印度的存在是不丹与我国边境困境与外交问题的根本原因。
因此综合来看，不丹未与我国建交的问题是多方面的，也不是短时间能解决的。但随着中国综合实力和国际影响力的不断增强，中不建交并非大问题。