荷花在修剪时需保留植株下部侧芽，上部侧芽需剪除，新箭长成后可把尖掐掉。修剪时不修剪老枝，开过花的老叶片可修剪。如果枝条过于密集，可采用留强去弱的方式进行修剪。去掉过多的枝芽，使其保持在3-4个的主茎片。
令箭荷花在修剪的时候，首先需要根据花盆的大小，设计一个合适的高度和密度，一般保持株高在30——40cm即可。在令箭荷花的植株长到30cm的时候，可以先将植株上的生长点切掉，用小刀在茎部的嫩梢处轻轻的割一下，这样可以阻止植株继续生长，将花盆中的每个茎片都做同样的处理，那么整个植株就会显得高矮一致。
其次，在令箭荷花生长的时候，因为茎片已经停止长高，又不生长侧芽，所以就会长得粗壮并且充实，如果有侧芽长出，就需要及时的剪除，只保留从土里长出来的侧芽，如果枝条过于密集，可以采用留强去弱的方式进行修剪。要去掉过多的枝芽，使其保持在3到4个的主茎片即可，要及时的将令箭荷花的主茎片上过多的新生芽摘掉，以免影响开花。
最后是要修剪老枝，因为令箭荷花已经开过花的枝条已经老化，并且木质化，一般不会再开花了，最好是可以剪掉哪些已经开过花的老枝。