南京每天有4列直达到南通的火车，发车时间是：06：30，08：32，11：58。14：04。没有夜间1点多的火车从南京回南通的。
车次始发站发站发点到站到点里程运行时间类型票价(单位：元)
K570重庆北南京06:44南通10:09153小时25分钟快速44(硬座)95(硬卧)142(软卧)
N454南京南京08:32南通12:21153小时49分钟快速44(硬座)67(软座)
5096南京南京14:08南通18:00153小时52分钟普快22(硬座)
T782上海南京18:31南通22:28153小时57分钟特快67(软座)
K1983次是由吉林开往南通的快速列车。13：33在吉林始发，沿途经26个停靠站后于14：12到达徐州，14：27又从徐州开出，途经宿州、蚌埠、扬州、泰州等4个停靠站后到达了终点站南通。
北京发往南通的火车晚上七点二十开车的是Z51次，正点早上八点零八分到达南通站，全程运行十二小时四十八分钟！时刻表如下：
你好。北京到南通，只有一个班次火车。
Z51次，途经:北京，徐州，沭阳，淮安，盐城，东台，海安县，如皋，南通。
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